Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
A4GALTQ9NPC4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms