Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KIAA1549Q9HCM3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KIAA1549Q9HCM3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms