Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NTN4Q9HB63 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms