Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REEP4Q9H6H4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms