Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SENP6Q9GZR1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SENP6Q9GZR1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms