Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AMBRA1Q9C0C7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AMBRA1Q9C0C7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms