Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM4Q9C037 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM4Q9C037 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms