Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
YTHDF1Q9BYJ9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms