Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRIP1Q9BX63 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms