Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
THUMPD2Q9BTF0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms