Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRACR2AQ9BSW2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CRACR2AQ9BSW2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms