Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NICN1Q9BSH3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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