Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLF1Q9BQI6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms