Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBGCP6Q96RT7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP6Q96RT7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms