Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SORCS2Q96PQ0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms