Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDLIM2Q96JY6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms