Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LTV1Q96GA3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms