Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CMTM5Q96DZ9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms