Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms