Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM52Q96A61 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM52Q96A61 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms