Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTSSAQ969W0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms