Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms