Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HLA-CQ95604 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms