Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHMTQ93088 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHMTQ93088 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHMTQ93088 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHMTQ93088 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHMTQ93088 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHMTQ93088 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHMTQ93088 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHMTQ93088 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms