Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PALLDQ8WX93 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PALLDQ8WX93 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms