Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms