Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MCOLN3Q8TDD5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms