Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms