Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms