Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND94

LRRN4CL, LRRN4 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4CLQ8ND94 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRN4CLQ8ND94 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms