Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACBD4Q8NC06 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms