Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L2Q8NAA4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms