Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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RNF182Q8N6D2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RNF182Q8N6D2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNF182Q8N6D2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RNF182Q8N6D2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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