Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z408

CSMD2, CUB and sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSMD2Q7Z408 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSMD2Q7Z408 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms