Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG9AQ7Z3C6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms