Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms