Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMIM5Q71RC9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMIM5Q71RC9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms