Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP50Q70EL3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms