Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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