Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC137Q6PK04 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms