Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LETMD1Q6P1Q0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms