Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ECM29Q5VYK3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms