Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SUSD4Q5VX71 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUSD4Q5VX71 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms