Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf135Q5VTT2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms