Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FRMPD1Q5SYB0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FRMPD1Q5SYB0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms