Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms