Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
COLEC12Q5KU26 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COLEC12Q5KU26 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms