Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COBLL1Q53SF7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COBLL1Q53SF7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms