Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms