Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms